土壤采样时，应在地形相对平坦、稳定的地点，采集20～100cm（深层）不同层次，且具有代表性部位的土壤样品，每个样品湿重不少于1kg，分别装入特质塑料袋，不混合样品，加标签带回实验室。样品除去植物根、石块等，放置阴凉处风干，用玻璃瓶压碎，采用四分法取弃土，通过80目分样筛，装瓶做分析备用。
在采样现场样品必须逐件与样品登记表、避免混淆和玷污。对光敏感的样品应有避光外包装。由专人将土壤样品送回实验室，送样者和接样者双方同时清点核实样品，并在样品交接单上签字确认，样品交接单由双方各存一份备查。
对于易分解或易挥发等不稳定组分的样品要采取低温保存的运输方法，并尽快送到实验室。
分析测试项目需要新鲜样品的土样，采集后用可密封的聚乙烯或玻璃容器在4℃以下避光保存，样品要充满容器。避免用含有待测组分或对测试有干扰的材料制成的容器盛装保存样品，测定有机物污染物用土壤样品要选用玻璃容器保存。
